在李玄霸的亲自看守下，李建成的军队寸步难行。效忠李世民的军队牢牢把握着李世民的退路，最终让李世民及其麾下一众军马有惊无险地杀出了长安城。
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日出东方，天色已明，而李渊驾崩的消息也已经传遍了整个长安城。
国不可一日无君，在诸多文武大臣的拥戴下，太子李建成登基称帝，成为大唐王朝的第二任帝王，改年号永昌。
登基之后，追随李建成的大臣和世家大族纷纷水涨船高，而跟李世民关系密切的大臣都遭到了清算，大将军窦抗被贬为庶人回家闭门思过，原本坐镇潼关的大帅柴荣和蒲津关的郭子仪虽然官职还在，但是军权被夺走，只能闲居长安。李建成又下旨剥夺李世民所有爵位，从族谱中除名。
十日后，逃出长安的李世民在陇右发布檄文，指责兄长李建成淫乱宫闱，与庶母尹德妃张婕妤有染，谋害父皇弑君篡位，拒不承认李建成的帝位，自封奉天讨贼大将军，仍用武德年号。
兄弟二人互相指责，关中之地风起云涌，军中将领纷纷站队，李唐彻底一分为二。
作为盟友的铁木真见兄弟相争，李唐分裂实力大减，忍不住破口大骂兄弟二人利欲熏心。为了抗衡实力愈发强劲的隋朝，决定出面给李氏兄弟说和。
可惜事与愿违，李氏兄弟虽然也明白内斗会让他们白白损耗自身的实力，但是正如杨杲当初所说的那样，皇位只有一个，李世民绝不会松口承认李建成的皇位，一旦君臣名分确认他日后再与兄长相争那就是造反，是不会得到任何人的支持。
而同样的，李建成则更不可能自己退位，否则不就是自打嘴巴承认李世民对他的指控，自己毁了自己的名声。
铁木真派来的使者几番调停，可李氏兄弟在根源上根本无法得到共识，当然也就无法和解。
在这期间，李渊的宠妃尹德妃倒是跳了出来，婉转地向李氏兄弟提议不若立她的儿子不到十岁的酆王李元亨为帝，以李建成和李世民为左右摄政王共理朝政。
这个想法倒是得到了铁木真的支持，既然李建成和李世民兄弟两个谁也不服谁，那不如现在两个都不立，改立一个幼子，让他们共理朝政分庭抗礼。
理想很丰满，现实却很骨干。就在铁木真的使者透露出这个想法的第二天，尹德妃和李元亨就离奇暴毙。
开玩笑，不管是李建成还是李世民，他们心里都明白，就算有突厥的支持，当下他们的目标也仅仅只是保住关中等现有的地盘，至于反攻隋朝实现一统大业那已经不是短时间可以实现的目标，十年二十年都已经算短了。
而等到十几年二十年后，李元亨一则已经成年，二则早就坐稳了帝位，那这皇位还有可能回到他们兄弟手中吗？真当他们兄弟是冤大头，白给尹德妃一家做长工？如果让已故的母亲窦皇后知道因为他们兄弟相争，最后把帝位落到了年纪比他们还小的庶母手里，只怕能从皇陵里蹦出来狠狠给兄弟两人一人一个大耳刮子。
但是尹德妃和李元亨的暴毙却是激怒了铁木真，以大漠苍狼自居的铁木真实际上极度反感这种调停事宜，在他眼里一切的困难都可以用自己的刀剑解决。这一次能强忍不快给兄弟两人说和已经是特别难为他了，结果这两兄弟还在背后给他搞小动作，气的一代天骄成吉思汗一怒之下做了甩手掌柜，不再管兄弟二人相争的事，他们爱怎么样就怎么样。
而杨杲则抓住李唐兄弟相争的时候，一心扑在了内政上。通过中书省下发的一道又一道的政令，各地官府整肃官吏，清明刑狱，劝农耕桑，实施屯田，紧锣密鼓地发展经济民生。